La Bibliothèque Diderot de Lyon est riche d'un fonds de manuels scolaires depuis les origines de ce genre jusqu'à nos jours. Cette collection a été constituée au fil des ans par des achats, des dons et par le dépôt légal de 1926 à 2014.
Aujourd’hui la collection de manuels scolaires continue de s’accroître par des achats et grâce à des dons d’éditeurs et de particuliers.
Cette collection d'environ 90 000 volumes de toutes disciplines est un des fleurons de la bibliothèque. Elle fait l'objet d'une politique de numérisation en concertation avec la BnF (Gallica).
Ces manuels sont catalogués dans le SUDOC. Ils sont exclus du prêt et conservés en magasin. Cette collection peut être utilement complétée par celle du Musée de l'Éducation à Rouen (Munaé).
On peut signaler particulièrement dans cet ensemble des manuels allemands de l’époque hitlérienne (1933-1945) dans diverses disciplines, sans doute confisqués à l'Allemagne à la fin de la guerre après avoir été exposés à la bibliothèque du Musée pédagogique.